С 1 по 16 июля 1979 года на Государственном полигоне Эмба бригада перевооружилась на новый тип ЗРК «Круг-М2». После получения техники с бригадой проведено тактическое учение с опытной боевой стыковочной стрельбой. 16 июля 1980 года, согласно постановления Президиума Верховного совета СССР от 12 ноября 1979 года, 49 зенитной ракетной бригаде вручено Боевое Знамя и Грамота Президиума Верховного Совета СССР. В 1986 г. за высокие достижения в боевой и политической подготовке, укреплении воинской дисциплины бригада награждена переходящим Красным Знаменем Военного Совета Сухопутных Войск. В период с 1 апреля по 25 июля 1987 года бригада проходила обучение в учебном центре войск ПВО СВ в г. Кунгуре Пермской области, после чего, с 1 августа по 15 октября 1987 года, на Государственном полигоне Эмба бригада была перевооружена на зенитный ракетный комплекс «Бук». 49 зенитной ракетной бригадой проведено 30 боевых стрельб из ЗРК «Круг», «Круг-М2», «Бук» и «Бук-М1-2». Командиры 49 зенитной ракетной бригады: полковник Суриков Николай Поликарпович (1968 – 1971), полковник Рабчевский Виталий Александрович (1971 – 1972), полковник Кобелев Владимир Михайлович (1972 – 1975), подполковник Ситник Игорь Викторович (1975 – 1979), полковник СтаринАнатолий Васильевич (1979 – 1982), подполковник Курзов Олег Яковлевич (1982 – 1984), полковник Поляков Олег Валентинович (1984 – 1986), подполковник Поправко Леонид Данилович (1986 – 1990), полковник Токмаков Николай Николаевич (1990 – 1994), полковник Тарасов Николай Васильевич (1994 – 1997), полковник Распопин Владимир Степанович (1997 – 2010), полковник Руденко Константин Андреевич (2010 – 2013), полковник Гришин Иван Иванович (с 2013 по н. в.).